GeneSetCart: Gen Set Analiz Aracı
GeneSetCart, kullanıcıların Rummagene ve RummaGEO'dan gen setleri ekleyebileceği etkileşimli bir web tabanlı uygulamadır. Bu araç, kullanıcıların çeşitli kaynaklardan gen setlerini almasına, bu setleri gen-gene koeksprasyonları veya protein-protein etkileşimleri ile zenginleştirmesine olanak tanır. Kullanıcılar, bir oturumda gen setlerini görselleştirebilir ve analiz edebilir, ayrıca tekil veya çoklu gen setlerini yükleyebilirler. PubMed'de yayınlarda belirtilen genleri arayarak gen setleri elde etme imkanı da sunar.
GeneSetCart, Venn diyagramları, ısı haritaları, UMAP, SuperVenn diyagramları ve UpSet grafikleri gibi çeşitli görselleştirme yöntemleri ile gen setlerini sunar. Kullanıcılar, oluşturdukları gen setlerinin işlevsel zenginlik analizini yapmak için Enrichr, Rummagene, RummaGEO gibi dış bağlantılara erişebilirler. Eklenen veya oluşturulan tüm gen setleri, yeniden analiz ve paylaşım için bir kullanıcı hesabında kaydedilebilir. Bu özellikler, hipotez oluşturma ve bilgi entegrasyonunu kolaylaştırmak için GeneSetCart'ı etkili bir kaynak haline getirir.
